More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2910 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
124 aa  240  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  87.1 
 
 
124 aa  213  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  87.9 
 
 
124 aa  213  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  87.1 
 
 
124 aa  213  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  87.1 
 
 
124 aa  213  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  87.1 
 
 
124 aa  213  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  86.29 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  86.29 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  87.9 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  86.29 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
125 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  55.74 
 
 
126 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
124 aa  136  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  54.84 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
124 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  49.19 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  49.19 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
123 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
123 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  48.39 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  48.39 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  54.7 
 
 
125 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
128 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
128 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  47.86 
 
 
128 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
124 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  42.15 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  38.14 
 
 
126 aa  91.3  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  36.07 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.71 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  43.37 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  50.63 
 
 
477 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.42 
 
 
490 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
507 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  36.45 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  29.27 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
507 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  44.59 
 
 
507 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.76 
 
 
493 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
477 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  41.77 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  46.15 
 
 
495 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  43.33 
 
 
463 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  29.82 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  33.06 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.59 
 
 
495 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  41.77 
 
 
477 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.83 
 
 
499 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
490 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
494 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  46.15 
 
 
494 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
494 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 
464 aa  67.4  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>