More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1077 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  86.89 
 
 		 126 aa  216  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  86.89 
 
 		 126 aa  216  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  86.89 
 
 		 126 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  86.07 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  84.43 
 
 		 126 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  50.44 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  44.35 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  41.13 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.14 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  38.94 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  32.23 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  35.45 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  35.96 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  34.19 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  35.04 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  33.64 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  44.9 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  36.44 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>