More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1243 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 137 aa  271  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  38.74 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  39.22 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  42.45 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.73 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  39.33 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  47.89 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  30.91 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  53.73 
 
 		 493 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  52 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 509 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  46.15 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  46.15 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  32.48 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 509 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  44.93 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  48.81 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  33.62 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  43.3 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 467 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  48.61 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  40.68 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40 
 
 		 461 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>