More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2305 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  60.8 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  61.79 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  52.8 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  52.5 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  53.23 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  51.26 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  35.77 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  39.51 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  41.25 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  33.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 496 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  37.84 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 507 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  41.03 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  46.58 
 
 		 507 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 507 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 554 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 476 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  30.43 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 488 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  39.47 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 328 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 498 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 473 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.19 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 520 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.74 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.68 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>