More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0185 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  55 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  51.26 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  51.3 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  46.61 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  45.69 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  37.39 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  35.4 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  31.62 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  31.09 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  30.36 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.23 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>