More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3111 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 134 aa  264  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  62.83 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 119 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  67.89 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  59.29 
 
 		 119 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  63.06 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  48.78 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  44.27 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  49.51 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  50.47 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  50.47 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  52.29 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  50.96 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  60.27 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  33.9 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  33.9 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  40.87 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  32.97 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  23.53 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  33.65 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0365  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  29.81 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  32.43 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  31.53 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 480 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>