More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0983 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  57.03 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  50.83 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  51.26 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  50.43 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  46.51 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  38.46 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  34.78 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  35.14 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  41.33 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  34.15 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  29.2 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  43.84 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.5 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1621  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  36.94 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  47.56 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.71 
 
 		 468 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 482 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 321 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  40.16 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 473 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.24 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 476 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 554 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  38.46 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>