270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2708 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  100 
 
 
90 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  98.82 
 
 
126 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  97.65 
 
 
126 aa  166  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  97.65 
 
 
126 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  97.65 
 
 
126 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  97.65 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  95.29 
 
 
126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  52.27 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  60.26 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  53.01 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  50.6 
 
 
123 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  52.44 
 
 
131 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  52.87 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  60.27 
 
 
134 aa  93.6  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  54.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  57.33 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  58.11 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  55.84 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  51.81 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  50.65 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  48.19 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  53.25 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  48.75 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  53.25 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  55.71 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  48.05 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  41.67 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
123 aa  67  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  38.1 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 
238 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.75 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  36.92 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  37.88 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  37.88 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
243 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  37.88 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  33.82 
 
 
364 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.71 
 
 
473 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
267 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>