More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0952 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  47.12 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  49.45 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  45.36 
 
 		 166 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  46.39 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  30.09 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  39.19 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  30.91 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  25.66 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  28.71 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.19 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  47.76 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  29.63 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  29.63 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 471 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  30.67 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  33.75 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.18 
 
 		 468 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  37.5 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.65 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  42.62 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  25.45 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>