More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2376 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  42.4 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  47.01 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  40.83 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.43 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  28.68 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  34.82 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 328 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 498 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 328 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 329 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  34.55 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.36 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  41.89 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 496 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 327 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  30.97 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 505 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 325 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  38.24 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>