89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1900 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  53.01 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  53.66 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  51.19 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  43.37 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  43.37 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  43.37 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  50.63 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  37.35 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  54.55 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  38.75 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.25 
 
 		 461 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.25 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 478 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  52.78 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 477 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 477 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.27 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 		 490 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  52.78 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 477 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  44.44 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 477 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 465 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  51.11 
 
 		 465 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 126 aa  40  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 479 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 137 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>