More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0073 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  42.34 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  52.05 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  46.43 
 
 		 478 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  37.8 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  37.8 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52 
 
 		 468 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  42.67 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.08 
 
 		 514 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.58 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 500 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 477 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 499 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  37.01 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  34.19 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.47 
 
 		 465 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 476 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  29.36 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 501 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.74 
 
 		 486 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 471 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.35 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>