More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0548 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
123 aa  237  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  65.52 
 
 
119 aa  146  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  60.53 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  60.53 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  62.18 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  72.97 
 
 
125 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  52.14 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
121 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
133 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
133 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
119 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  53.85 
 
 
121 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  48.84 
 
 
132 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  52.44 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  48.25 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  50.41 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  46.79 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  48.25 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  57.14 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  47.75 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  52.5 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 
133 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.06 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  32.52 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.77 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  31.15 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  33.9 
 
 
321 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  46.75 
 
 
498 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  29.82 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  47.95 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.67 
 
 
593 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 
464 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 
477 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  40.79 
 
 
476 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  42.5 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>