229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0345 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0345  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 78 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631612  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0299  regulatory protein GntR, HTH  67.09 
 
 		 79 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0344  GntR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.392311  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  38.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  38.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  38.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  38.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  38.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 240 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5299  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 259 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 482 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.9 
 
 		 487 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  37.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 244 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3803  regulatory protein GntR, HTH  37.88 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704328  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 245 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.19 
 
 		 474 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.29 
 
 		 468 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.62 
 
 		 487 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  36.99 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6358  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 		 489 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 521 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  46.34 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  38.6 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  32.89 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  35.06 
 
 		 321 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 496 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 483 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 472 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  32.31 
 
 		 471 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  35.48 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 477 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  33.9 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 496 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 237 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 239 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 249 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3094  regulatory protein GntR HTH  32.81 
 
 		 486 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0435211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  33.77 
 
 		 504 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  34.85 
 
 		 274 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 496 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  35.82 
 
 		 240 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1691  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0269955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 483 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  43.14 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  40.3 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.81 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 492 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 442 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.38 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  36.76 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  36.21 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>