More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6358 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6358  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5299  GntR family transcriptional regulator  84.48 
 
 		 234 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3803  regulatory protein GntR, HTH  65.8 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704328  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  28.91 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 287 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0129  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.91 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.83 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  28.17 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  30.41 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  25.11 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.88 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.68 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  35.09 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  38.46 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>