More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1940 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  30 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  28.96 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  29.96 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.5 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.36 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.12 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.74 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.02 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  32.47 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.02 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.02 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.02 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  24.35 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.02 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  22.69 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  23.91 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>