More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5299 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5299  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6358  GntR family transcriptional regulator  84.48 
 
 		 234 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3803  regulatory protein GntR, HTH  69.7 
 
 		 239 aa  341  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704328  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0129  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  28.44 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  30.52 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.92 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.33 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.4 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  29.19 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3347  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.546924  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3357  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.568535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  28.11 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.53 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  24.44 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  26.13 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  47.69 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>