More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0752 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2073  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0165652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.53 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  23.44 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  38.75 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  38.75 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  38.75 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  38.75 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  40 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  43.08 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  43.08 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  27.81 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  39.71 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15140  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  39.71 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  33.72 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  38.36 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.22 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  37.68 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  24.49 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  46.03 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  38.89 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  43.55 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  41.54 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  24.9 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>