More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3880 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  39.37 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.34 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  34.72 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  34.72 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.72 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.72 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.72 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  34.72 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  23.31 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  26.72 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  25.11 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.03 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  25.59 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  25.59 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  25.59 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  25.59 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  23.21 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  28.95 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.95 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>