More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0369 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  97.53 
 
 		 243 aa  483  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2073  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0165652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  27.82 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  27.82 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1740  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000284043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  41.89 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  38.82 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  39.56 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  37.25 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  37.25 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  39.51 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  37.65 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.67 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  47.54 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.01 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  41.03 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  40.45 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  30.53 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  39.24 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  40.62 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  41.89 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  33.02 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  32.38 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  32.38 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  48.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  39.24 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  43.18 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  21.4 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35.14 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  38.89 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  45.31 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  40.51 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  49.18 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  49.18 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  49.18 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.75 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.33 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1014  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>