168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3094 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3094  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 486 aa  986    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0435211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  43.55 
 
 		 120 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 121 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 125 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.92 
 
 		 241 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.85 
 
 		 238 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  40.98 
 
 		 237 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0516  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 88 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 533 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 117 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 230 aa  50.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 266 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.71 
 
 		 230 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  29.05 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 113 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 113 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.78 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.91 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  40.32 
 
 		 86 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  25 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  41.43 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.57 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 239 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 263 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7481  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.37 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 83 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 128 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  40.3 
 
 		 243 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 151 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  38.03 
 
 		 256 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 490 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  28.33 
 
 		 229 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  35.63 
 
 		 251 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  35.63 
 
 		 251 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  27.33 
 
 		 229 aa  47  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 249 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  39.71 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  36.76 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 230 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  37.29 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 239 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 251 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 239 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  28.84 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28 
 
 		 240 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  32.16 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 120 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  27.97 
 
 		 240 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 251 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 124 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  27.97 
 
 		 240 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  38.27 
 
 		 239 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  26.99 
 
 		 239 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>