More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7481 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7481  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7505  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  25.87 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  25.84 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  34.58 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.65 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  26.9 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  46.88 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.44 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  40.91 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  25.41 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  40.91 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  41.79 
 
 		 366 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  41.18 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  24.43 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 119 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  32.84 
 
 		 126 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.25 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  32.84 
 
 		 126 aa  52  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.17 
 
 		 490 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  39.47 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  35.9 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  27.59 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  22.62 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  23.86 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 117 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  24.49 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.89 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  38.24 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  36.92 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  26.9 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 125 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.92 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 124 aa  48.5  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.37 
 
 		 498 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.17 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  27.17 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 477 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  41.54 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 481 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.54 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.14 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 497 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  40.32 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  36 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  44.64 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  40 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.14 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1467  GntR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.17 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>