More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7505 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7505  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7481  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  28.02 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  40.91 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.08 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  27.06 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  23.32 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  28.57 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4157  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  39 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  24.78 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4999  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4576  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4595  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4956  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  38.89 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4984  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  39.53 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  25.83 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.78 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  27.78 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4736  GntR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5096  GntR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0126  transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000292092  hitchhiker  0.0000000000517397 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.43 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  24.14 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  24.14 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  27.7 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  27.7 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  27.7 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  28.25 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.11 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  24.26 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0264  transcriptional regulator, GntR family  23.88 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4685  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  29.93 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.44 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2932  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1576  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.73 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0273735  normal  0.277013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  47.76 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  26.35 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4971  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  23.81 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  23.71 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  23.14 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  23.27 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  23.71 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  23.71 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.18 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 92 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  23.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  45 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  23.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>