More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4874 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  63.74 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27100  transcriptional regulator  55.22 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.79 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  42.86 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  46.88 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  44.16 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 478 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  44.12 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  44.12 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  45.71 
 
 		 474 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 241 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.26 
 
 		 472 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 338 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.1 
 
 		 243 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 447 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.48 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 460 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  40.26 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.25 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  37.5 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  40.23 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  38.16 
 
 		 301 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.08 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  41.33 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 447 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2758  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 447 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 447 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.88 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  41.03 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  46.88 
 
 		 493 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 468 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  38.04 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  44 
 
 		 252 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 470 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  42.25 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 365 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 256 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>