More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1606 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 271 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  31.58 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.11 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  31.55 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.5 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.76 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.76 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.76 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  36.17 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.76 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.76 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  31.07 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.76 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31.07 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31.07 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.09 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.37 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  29.61 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>