More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4214 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  64.14 
 
 		 237 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  63.71 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  68.09 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  58.58 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  60.91 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  44.71 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  40.09 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  43.27 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  39.37 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  39.72 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  36.56 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  37.79 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  36.25 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  36.89 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  38.86 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  40.86 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  40.86 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  40.86 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  36.79 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  36.79 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  36.79 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  37.26 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  37.31 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  39.46 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  36.06 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  43.65 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  38.5 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  35.38 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  38.68 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  42.72 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  34.91 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  35.1 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  40.51 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  37.33 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  37.8 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 232 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.9 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  33.62 
 
 		 239 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  36.04 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  37.14 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  31.28 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  29.03 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  32.21 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  32.68 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  37.67 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>