More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1259 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  99.16 
 
 
237 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
237 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  79.32 
 
 
238 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  79.32 
 
 
238 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  79.75 
 
 
238 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  79.32 
 
 
238 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  79.32 
 
 
238 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  79.32 
 
 
238 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  78.9 
 
 
238 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  73.22 
 
 
239 aa  329  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  72.2 
 
 
241 aa  322  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  68.26 
 
 
248 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4715  GntR domain protein  40.69 
 
 
232 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  42.79 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2284  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
439 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  35.84 
 
 
239 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  33.48 
 
 
248 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
238 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  34.33 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  32.84 
 
 
246 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  37.75 
 
 
241 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  37.36 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  35.96 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  33.69 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  36.06 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  30.85 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  32.87 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 
241 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
240 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  33.03 
 
 
242 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.34 
 
 
238 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 
252 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  35.32 
 
 
241 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 
253 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  34.01 
 
 
244 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 
252 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
238 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
238 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
238 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 
250 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 
240 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  32.08 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.41 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  31.63 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  34.97 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  34.97 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  34.97 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.96 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  33.33 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  34.07 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
230 aa  92  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  29.33 
 
 
277 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.02 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
192 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  30.67 
 
 
251 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
230 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
230 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  27.56 
 
 
230 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  27.56 
 
 
230 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 
230 aa  89  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  27.56 
 
 
230 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
261 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 
230 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>