More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1899 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  44.14 
 
 
235 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  45.7 
 
 
239 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  44.14 
 
 
243 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  37.61 
 
 
238 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  41.71 
 
 
253 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  38.99 
 
 
246 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
240 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  37.38 
 
 
250 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  35.51 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  38.95 
 
 
244 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  34.74 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  32.14 
 
 
239 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  35.05 
 
 
261 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  35.71 
 
 
240 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  36.68 
 
 
236 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  33.18 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  35.29 
 
 
237 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  33.81 
 
 
246 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 
274 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  38.29 
 
 
268 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
237 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
237 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
237 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 
287 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 
238 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  37.38 
 
 
240 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  33.05 
 
 
238 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  31.97 
 
 
245 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
239 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 
237 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  33.5 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  37.88 
 
 
268 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  33.01 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  33.01 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  33.01 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  34.88 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  29.82 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  32.84 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  37.64 
 
 
192 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  37.64 
 
 
192 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  37.64 
 
 
192 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  33.97 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  31.65 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  35.07 
 
 
266 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  33.33 
 
 
241 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  36.89 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  34.15 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  31.51 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.93 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  31.28 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.71 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  33.33 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  28.11 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  32.86 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  32.47 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>