More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5012 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  100 
 
 		 239 aa  460  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  56.33 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  50.9 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  39.37 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  42.73 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  40.27 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  43.78 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  34.89 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  43.44 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  40.89 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  38.46 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  42.04 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  35.32 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  38.94 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  35.45 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  35.45 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  35.45 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  40.78 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  41.86 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  36.55 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  36.7 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  36.16 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  44.44 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  35.96 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  36.16 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  36.65 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  44.12 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  43.92 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  40.64 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  36.76 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  44.57 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  36.16 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  35.48 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 192 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  34.11 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  35.71 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  36.84 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  34.12 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  36.36 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  36.32 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  36.79 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  36.11 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  37.5 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  36.91 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  34.15 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>