More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5298 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  65.32 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  54.3 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  53.1 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  56.02 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  50.23 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  50.22 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  49.11 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  51.74 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  46.61 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  53.02 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  45.37 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  37 
 
 		 277 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  35.84 
 
 		 248 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  34.67 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  33.48 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.25 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  39.29 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  35.59 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  33.95 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  31.63 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  35.87 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  30.41 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  37.06 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  32.88 
 
 		 261 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  35.4 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.49 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  40.23 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  30.77 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  33.62 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  30.72 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.9 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  34.12 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  30.72 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  30.72 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  31.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  35.41 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.67 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  35.55 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  34.91 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  27.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  27.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  35.09 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  27.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>