More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1368 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 119 aa  233  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  65.52 
 
 		 123 aa  146  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  64.35 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  63.06 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  57.39 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  46.83 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  46.43 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  49.57 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  45.79 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  46.43 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  46.36 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  48.94 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  50.98 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  51.25 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  26.89 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  41.77 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3852  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.62358  normal  0.635405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  33.05 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 482 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  40.26 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  34.62 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 461 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 463 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.84 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  46.49 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.93 
 
 		 480 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.39 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 500 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>