More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  48.25 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  46.46 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  44.64 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  50.43 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  51.96 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  44.64 
 
 		 121 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  49.43 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  56 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  51.25 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  49.33 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  60.32 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  45.21 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  41.12 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  40.91 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  42.86 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  43.75 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 328 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  45.12 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  56.72 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.45 
 
 		 593 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 432 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  46.43 
 
 		 436 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  43.82 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  54.1 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.89 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  47.44 
 
 		 586 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.38 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5165  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.469019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  28.93 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 479 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 333 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 331 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 464 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 329 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  44.87 
 
 		 493 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 508 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  38.82 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  35.53 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  44.29 
 
 		 431 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 328 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  41.57 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  41.77 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.11 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 458 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 473 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>