More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1998 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 132 aa  255  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  46.83 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  48.84 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  68 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  47.9 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  59.21 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  46.46 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  60.53 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  56 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  45.69 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  42.86 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  41.73 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  67.14 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  39.8 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  53.95 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  59.55 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  36.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  31.68 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.33 
 
 		 435 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  44.16 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  53.73 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  44.87 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  37.19 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 470 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  30.89 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 520 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  30.47 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 498 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 554 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  33.66 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  33.66 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.62 
 
 		 469 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.1 
 
 		 462 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 432 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 492 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 465 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.31 
 
 		 593 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 461 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44 
 
 		 480 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  42.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>