More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2355 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 128 aa  236  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  56.56 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  56.91 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  67.14 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  45.3 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  56.79 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.3 
 
 		 473 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  54.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  49.4 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  51.35 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  46.49 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  49.28 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  50.72 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  53.03 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  64.86 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  37.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  44.59 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  56.94 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  56.72 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  55.07 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  50 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  49.3 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 547 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  46.25 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  27.97 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.17 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  56.92 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  40.79 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 476 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 482 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.16 
 
 		 517 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>