More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2572 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 120 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  60.53 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  57.39 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  47.46 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  58.23 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  48.82 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  53.66 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  46.67 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  53.57 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  61.25 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  50.43 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  51.67 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  37.5 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  53.01 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  40.23 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  29.66 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  40.71 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 327 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  33.04 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  60.87 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.2 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  46.84 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 464 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  40.26 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  45.33 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 467 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 507 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 507 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 507 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.32 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  38.75 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 511 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.84 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 321 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 513 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 480 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.54 
 
 		 480 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>