More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2599 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
133 aa  253  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  47.9 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  59.09 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  49.38 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  52.7 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  42.02 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  32.76 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  53.42 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  51.52 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  44.71 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  35.44 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  35.44 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
477 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.55 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  32.69 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  25.2 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  30.25 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  32.69 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  29.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  36.9 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  36.78 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  39.5 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  42.73 
 
 
121 aa  57  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0668  regulatory protein GntR HTH  56.1 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000391689  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  28.32 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  24.8 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  42.42 
 
 
498 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
249 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
471 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 
477 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>