More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4945 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 125 aa  234  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  63.48 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  65.52 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  63.16 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  54.78 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 121 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  45.22 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  45.22 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  61.04 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  57.5 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  46.79 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  51.32 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  51.25 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  35.04 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  52 
 
 		 128 aa  66.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  42.5 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  34.71 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 464 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  41.03 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  49.21 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.79 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.51 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.67 
 
 		 475 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 477 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.31 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  25.86 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 461 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  29.57 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 331 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 466 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  38.16 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>