More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1819 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  47.41 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  50.49 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  51.82 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  45.54 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  50.96 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  47.66 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  45.28 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  49.58 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  53.95 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  52.11 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  46.46 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  55.38 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  60.32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  55.07 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  45.88 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 480 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  54.1 
 
 		 434 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  46.32 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  49.32 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  40.79 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  31.19 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  44.66 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  35.44 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  37.08 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  37.08 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 465 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 432 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  47.92 
 
 		 455 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.82 
 
 		 489 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.76 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.48 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4272  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.76 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200991  normal  0.884881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  32.11 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.18 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 477 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  38.24 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 477 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>