More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4623 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 489 aa  1015    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.98 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.32 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.34 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.59 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 477 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 499 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 492 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.2 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.54 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.39 
 
 		 472 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.25 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.18 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.54 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 475 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 507 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.71 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.27 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.52 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.01 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 488 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 547 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 508 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 498 aa  200  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.52 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  26.83 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  29.81 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  29.57 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 496 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.69 
 
 		 495 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.25 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.8 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.23 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.84 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 490 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>