More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4822 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 496 aa  1017    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.57 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.94 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.55 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.98 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.25 
 
 		 477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 521 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 498 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.4 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.25 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.11 
 
 		 487 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.01 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 503 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 484 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 491 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 490 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 485 aa  180  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.85 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.07 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.22 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 569 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  24.94 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.54 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.51 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 493 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.64 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 477 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 477 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 496 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.93 
 
 		 495 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.22 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.06 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 477 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 494 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  22.96 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  25 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 508 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 501 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.46 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 498 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.22 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 520 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 503 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.34 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 501 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  26.03 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.46 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>