More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4061 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  99.17 
 
 		 133 aa  237  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  99.17 
 
 		 133 aa  237  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  78.33 
 
 		 121 aa  190  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  77.5 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  66.1 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  52.07 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  56.96 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  56 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  51.85 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  45.97 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  46.02 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  47.01 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  58.82 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.76 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  29.31 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.05 
 
 		 471 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 476 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  33.04 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  50.72 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50 
 
 		 593 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 432 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 508 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 304 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 498 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 		 506 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  44.78 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 464 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.53 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.86 
 
 		 498 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  46.97 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  36.08 
 
 		 488 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 512 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.04 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 479 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 509 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 482 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.9 
 
 		 488 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>