More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4569 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 121 aa  240  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  86.78 
 
 		 121 aa  216  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  77.5 
 
 		 121 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  76.67 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  76.67 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  68.42 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  53.85 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  58.23 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  45.69 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  46.22 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  45.54 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  60.29 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  50.98 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  42.55 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  39.76 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 506 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  29.31 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 496 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 506 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 509 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 506 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  31.9 
 
 		 122 aa  66.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 507 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  41.03 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.59 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.63 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 506 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 506 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 506 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  36.89 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 432 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  39.47 
 
 		 321 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.7 
 
 		 508 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 493 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 434 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.03 
 
 		 593 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  29.29 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>