More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8884 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 146 aa  290  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  63.49 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  53.72 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  53.23 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  49.18 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  47.58 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  37.78 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  42.68 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  28.46 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 		 321 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 		 468 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 498 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  29.06 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 482 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  27.12 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  27.34 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 547 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  41.79 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  41.79 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 520 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.79 
 
 		 471 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.26 
 
 		 483 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.67 
 
 		 494 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  44 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.26 
 
 		 483 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 477 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 477 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 483 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  38.67 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  35.71 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>