285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3130 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 356 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 117 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1267  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 125 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  42.31 
 
 		 97 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  32.46 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 116 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 139 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 117 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 117 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 126 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.36 
 
 		 472 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.36 
 
 		 472 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 129 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 126 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 126 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 126 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 		 139 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 123 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 123 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  26.19 
 
 		 126 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 		 139 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 321 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  38.89 
 
 		 125 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 126 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  40.85 
 
 		 121 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 503 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.99 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  30.37 
 
 		 156 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 129 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.25 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 118 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.49 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 520 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 139 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 120 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 118 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 125 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 129 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  28.46 
 
 		 126 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 125 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 115 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  37.21 
 
 		 139 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.33 
 
 		 494 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 128 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.16 
 
 		 501 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 113 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  38.33 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 113 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 120 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  31.31 
 
 		 166 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 561 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 546 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 126 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 564 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 137 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>