265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0516 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0516  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 241 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  34.92 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  34.92 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 245 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 238 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3094  regulatory protein GntR HTH  42.67 
 
 		 486 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0435211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 248 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 277 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 243 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 237 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 244 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  32 
 
 		 245 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 277 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  34.85 
 
 		 236 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  34.38 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 276 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  34.85 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.67 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 244 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 242 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  35.94 
 
 		 235 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 247 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 365 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 246 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  32.84 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  32.84 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.88 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>