More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1575 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  173  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 
285 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  42.86 
 
 
251 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  43.24 
 
 
251 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 
243 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  42.86 
 
 
251 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  43.48 
 
 
251 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  43.48 
 
 
251 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  43.48 
 
 
251 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1646  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.041881  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0516  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
253 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 
246 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
243 aa  60.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.16 
 
 
253 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
240 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
246 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  50.77 
 
 
243 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.57 
 
 
255 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
266 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
255 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40.58 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
249 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.37 
 
 
271 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
255 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  47.76 
 
 
240 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
239 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 
246 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 
240 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 
240 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
239 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
245 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 
244 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 
261 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
263 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 
241 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
266 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
267 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.19 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
245 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.91 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
243 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  37.97 
 
 
239 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
278 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
259 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 
257 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  38.46 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  38.46 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 
245 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  38.16 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  38.16 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  38.16 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
244 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
252 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  40.58 
 
 
241 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
264 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
247 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
278 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
248 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 
238 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  41.18 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  40.58 
 
 
241 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
276 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 
280 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  41.18 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
267 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
249 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
274 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  37.31 
 
 
236 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
256 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
247 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  40.58 
 
 
241 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  40.58 
 
 
241 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 
242 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
263 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  38.46 
 
 
245 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>