More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1841 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 83 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 263 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  52.94 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  52.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  42.86 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 249 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 241 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 243 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  45.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.79 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 249 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  40.79 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  39.24 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  41.18 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 249 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  40 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  40 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  40 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 244 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 244 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 243 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 247 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.1 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.1 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 376 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 507 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  46.27 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>