More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0482 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  45.83 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0516  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  33.85 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  36.99 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  46.15 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  41.1 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  35.05 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.62 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 520 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.86 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 442 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 264 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 248 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  37.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.5 
 
 		 253 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 338 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 244 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.62 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  38.81 
 
 		 484 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.68 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.82 
 
 		 286 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 490 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 287 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 251 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 246 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 274 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.39 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  37.31 
 
 		 251 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 262 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.62 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  44.62 
 
 		 244 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 475 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>