More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5605 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  30.58 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.06 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.66 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  26.64 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  25.48 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.29 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  30.42 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  27.48 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.33 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.46 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  24.8 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  27.1 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  23.51 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>