More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0259 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 78 aa  156  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  52.31 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  50.77 
 
 		 368 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 242 aa  62  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  49.28 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  48.61 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  47.83 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 252 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 256 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  47.54 
 
 		 241 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 247 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  48.05 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  45.59 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  46.88 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  41.79 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  44.93 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 256 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 332 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 376 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 260 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  42.19 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0634  UbiC transcription regulator-associated  43.66 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.124125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  42.42 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40.91 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  40 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0648  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.69 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.59 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.97 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  36.92 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  39.71 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 287 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  42.65 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 241 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 241 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 241 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>